Biyoinformatik ve Genetik Bölümü Koleksiyonu
Permanent URI for this collectionhttps://gcris.khas.edu.tr/handle/20.500.12469/46
Browse
Browsing Biyoinformatik ve Genetik Bölümü Koleksiyonu by Scopus Q "Q4"
Now showing 1 - 6 of 6
- Results Per Page
- Sort Options
Article Citation Count: 0"2-pirazolin yapısındaki yeni bir bileşiğin sentezi, moleküler modellemesi ve monoaminoksidaz inhibitörü etkisinin araştırılması"(Türkiye Halk Sağlığı Kurumu, 2018) Yelekçi, Kemal; Uçar, Gülberk; Yelekçi, KemalAmaç: Nöromediatörlerin yıkımından sorumlu olan monoamin oksidaz (MAO) enziminin izoformlarının (MAO-A ve -B) birçok hastalık ile yakından ilişkili olduğu; MAO inhibitörlerinin depresyon, Parkinson ve Alzheimer hastalığı gibi hastalıkların tedavisinde kullanıldığı bilinmektedir. Grubumuzca daha etkin, tersinir ve az yan etkili yeni bir MAO inhibitörü (SH2U bileşiği) sentezlenmiş ve bu bileşiğin insan MAO enzimini (hMAO) inhibe etme yeteneği incelenmiştir. Ayrıca bu yeni bileşiğin hMAO ile etkileşimi, moleküler modelleme çalışmaları ile detaylı bir şekilde araştırılmıştır. Sentezlenen yeni bileşiğin hMAO’yu kuvvetli bir şekilde yarışmalı ve tersinir olarak inhibe ettiği bulunmuştur. Söz konusu bileşiğin Parkinson ve Alzheimer hastalıklarının tedavisinde ümit verici bir ilaç etken maddesi olabileceği düşünülmektedir. Yöntem: 3’,5’-Dikloro-2’-hidroksi asetofenon ile p-tolualdehit’in metanol içinde KOH varlığında reaksiyona girmesiyle 1-(3,5-dikloro-2-hidroksifenil)- 3-p-tolil prop-2-en-1-on (3’,5’-Dikloro-2’-hidroksi-4- metil şalkon) bileşiği sentez edilmiştir. Daha sonra elde edilen bu bileşiğin etanol içerisinde geri çeviren soğutucu altında izonikotinik asit hidrazit ile muamele edilmesiyle [3-(3,5-dikloro-2-hidroksifenil)-5-p-tolil-4,5- dihidropirazol-1-il] (piridin-4-il) metanon bileşiği sentez edilmiştir. Yapısı doğrulanan bu bileşiğin hMAO enzimi ile etkileşimi, ticari tayin kiti kullanılarak fluorometrik bir yöntemle incelenmiştir. Ayrıca, söz konusu yeni bileşik ile hMAO arasındaki etkileşimler, moleküler modelleme çalışmaları ile aydınlatılmıştır. Bulgular: Sentezlenen bileşiğin yapısı, IR, Mass, 1H-NMR ve elemental analiz yöntemleri kullanılarak doğrulanmıştır. Yapısı doğrulanan bu bileşiğin etkin, seçici, tersinir, toksik olmayan bir hMAO-B inhibitörü olduğu ve inhibisyonun yarışmalı olduğu görülmüştür. Moleküler yerleştirme programı kullanılarak bileşiğin hMAO-B enziminin aktif bölgesinde hangi amino asit yan zincirleri ile ne tür girişimleri yaptığı belirlenmiştir. Sonuç: Yeni sentezlenen SH2U bileşiği, hMAO-B enzimini kuvvetle, seçici, yarışmalı ve tersinir olarak inhibe etmiştir. Sentezlediğimiz bileşik, bilinen seçici ama tersinmez MAO-B inhibitörü olan selejilin’den daha etkin ve seçici, tersinir olarak hMAO-B enzimini inhibe etmiştir ve Parkinson ile Alzheimer hastalığı tedavisinde kullanılabilecek bir ilaç etken maddesi olarak ümit vadetmektedir.Conference Object Citation Count: 0The Association of Gvhd With Hla Dr Alleles, Ifn-Gamma, Tgf-Beta, And Mbl2 Gene Polymorphism(Wiley, 2019) Oğuz, Rusdu; Çiftçi, Hayriye Şentürk; Gökçe, Muge; Öğret, Yeliz; Karadeniz, Sedat Tanju; Pehlivan, Sacide; Aydın, Filiz[Abstract Not Available]Article Citation Count: 3Elasticity Study of PAAm-kappa C Composite Prepared in Various kappa C Content and Measured at Several Temperatures(Polish Acad Sciences Inst Physics, 2015) Evingür, Gülşen Akin; Pekcan, ÖnderPolyacrylamide (PAAm)-kappa carrageenan (kappa C) composite gels were prepared via free radical crosslinking copolymerization with various (w/v) percentages of kappa C in the range between 0.5 and 3 (w/v)% of kappa C . Elasticity properties such as stress strain and compressive elastic modulus S of these composite gels were studied in various kappa C content and at several temperatures. The content and temperature dependence of the compressive elastic modulus S of the swollen PAAm-kappa C composite gels due to volume phase transition were produced by using tensile testing technique. It is understood that the compressive elastic modulus was found to decrease up to 1 (w/v)% of kappa C and then increase by increasing kappa C contents at constant temperatures. The composite preserves the ability to undergo the volume phase transition and its compressive elastic modulus is found to be strongly dependent on the kappa C content and temperature. It is observed that the compressive elastic modulus increased when temperature is increased up to 40 degrees C and then decreases below this temperature for all composite gels. However PAAm-kappa C composite gel presented lower values for the compressive elastic modulus showing a minima at 40 degrees C for 1 (w/v)% of kappa C content gel.Article Citation Count: 2Fractal Features and Structural Morphological Optical Characteristics of Sol-Gel Derived Silica Nanoparticled Thin Films(Polish Acad Sciences Inst Physics, 2018) Uysal, Bengü Özuğur; Pekcan, ÖnderNanostructured silica films using a simple and effective sol-gel spin coating technique were synthesized and the influence of ammonia/sol ratios on the particle size and thickness of this film was investigated. In addition fractal dimensions of the prepared films were determined using the scattering response technique. The samples were characterized by atomic force microscopy and UV-vis spectroscopy. Comparing optical method and image analysis of atomic force microscopy micrographs the fractal dimension of silica nanoparticled thin films was determined. The fractal dimensions of the films verified by atomic force microscopy analysis were found to be around 2.03 which is very close to the values (2.0358 2.0325 and 2.0335) obtained using optical method. As a result of these findings precise determination of the nanoparticled silica thin films fractal dimension using both optical and surface analysis methods was realized.Article Citation Count: 4PAAm-kappa carrageenan composites: drying and swelling with various kappa carrageenan contents(Polish Acad Sciences Inst Physics, 2012) Akın-Evingür, Gülşen; Pekcan, ÖnderThe purpose of this study is to discuss the role of kappa-carrageenan (kappa-car) in the drying and swelling of polyacrylamide (PAAm)-kappa-car composite. The fluorescence intensity of pyranine increased and decreased as drying and swelling time were increased respectively for all samples. The desorption coefficient D-d decreased as kappa-car contents were increased for a given temperature during drying. However cooperative diffusion coefficient D-s increased as kappa-car contents were increased during swelling at a given temperature.Article Citation Count: 3Universality of elasticity on PAAM-NIPA copolymer gels(EDP Sciences, 2015) Evingür, Gülşen Akin; Pekcan, ÖnderPolyacrylamide (PAAm)-N-isopropylacrylamide (NIPA) copolymers were prepared via free radical crosslinking copolymerization with different molar of NIPA varying in the range between 0 and 2 M. The mechanical properties of swollen PAAm-NIPA copolymers were characterized by the compressive testing technique. It is understood that the compressive elastic modulus was found to increase by increasing NIPA contents keeping temperature constant at 30 degrees C. The critical exponent of elasticity y above the critical NIPA concentration is found to be as 0.74 which is consistent with the suggestions of percolation for superelastic percolation network (SEPN) and the critical theory for PAAm-NIPA copolymers.
