Çetin, Muhammet Mustafa

Profile Picture
Name Variants
Çetin, M.
Muhammet Mustafa, Cetin
Muhammet Mustafa ÇETIN
ÇETIN, MUHAMMET MUSTAFA
MUHAMMET MUSTAFA ÇETIN
Cetin, Muhammet Mustafa
M. Çetin
Çetin, M. M.
ÇETIN, Muhammet Mustafa
Çetin, MUHAMMET MUSTAFA
C.,Muhammet Mustafa
Muhammet Mustafa Cetin
Cetin, M.
M. Cetin
Cetin,Muhammet Mustafa
C., Muhammet Mustafa
Çetin, Muhammet Mustafa
Çetin,M.M.
M. M. Çetin
Cetin,M.M.
Muhammet Mustafa Çetin
Ç., Muhammet Mustafa
Çetin, M. Mustafa
Job Title
Dr. Öğr. Üyesi
Email Address
mustafa.cetin@khas.edu.tr
ORCID ID
0000-0002-6443-0232
Scopus Author ID
Turkish CoHE Profile ID
Google Scholar ID
WoS Researcher ID
Scholarly Output

4

Articles

2

Citation Count

79

Supervised Theses

1

Filters

2019 - 201912020 - 20243
Reset filters

Settings

Scholarly Output Search Results

Now showing 1 - 4 of 4
  • Thumbnail Image
    Master Thesis
    Mtor ve Hdac1 Enzimlerine Karşı Yüksek Güçlü ve Etkili Yeni Antikanser Terapötik İlaçlar Olarak 1,10-fenantrolin ve Prodigiosin Türevleri Serisi
    (2024) Gül, Sümeyye Berfin; Çetin, Muhammet Mustafa
    Meme kanseri, beyin metastazı olasılığı en yüksek olan ikinci kanser türü olarak kabul edilmektedir. Ancak bu kanser türüne özgü etkili bir antikanser terapötik/tedavisi mevcut değildir. Bu nedenle, meme kanserinin ilerlemesinde hayati önem taşıyan mTOR ve HDAC enzimlerini inhibe eden yeni ve etkili antikanser terapötik ilaçların/API'lerin oluşturulmasına yönelik artan bir ihtiyaç vardır. Bu çalışma, mTOR ve HDAC enzimlerini hedef alan yeni ve oldukça güçlü antikanser terapötik ilaçlar/API'ler olarak bir dizi prodigiosin ve 1,10-fenantrolin türevlerinin yapı-aktivite ilişkisini ve in silico modellemesini incelemiştir. Oldukça güçlü ligandları tanımlamak için doğal ürün Ps ile karşılaştırmalı analiz yapılmıştır. Bu ligandların MD simülasyonları gerçekleştirilmiş ve MD simülasyonlarının yörüngesinden, ligand-enzim komplekslerinin yapısal konformasyonlarını, stabilitesini, esnekliğini/dalgalanmasını ve genel boyutlarını değerlendirmek için RMSD, RMSF ve Rg parametreleri hesaplanmıştır. Ek olarak, Lipinski'nin beş kuralı ile yapılan ADMET çalışması farmakolojik potansiyeli değerlendirmektedir. Doğal ürün Ps ile karşılaştırıldığında, oldukça güçlü ligandlardan 20'si, özellikle 2a, 6b, 13 ve 13a, HDAC1 ve/veya mTOR enzimlerine karşı, -9,4 ila -7,1 kcal/mol arasında değişen umut verici bağlanma enerjileri ve 225 ila 569 nM arasında değişen inhibisyon sabitleri sergiler. Özellikle, 2a, 5, 6b, 7b ve 13 numaralı ligandlar, her iki enzime karşı etkili ikili etki sergiler. Ayrıca ADMET çalışmasına göre, seçilen ligandların hiçbiri Lipinski'nin beş kriterli kuralından ikiden fazlasını ihlal etmedi; bu da farmakolojik olarak aktif olma potansiyelinin çok umut verici olduğunu gösterdi. Sonuç olarak, in silico hesaplamalı modellemeyi kullanarak, aynı zamanda beyin metastazı riski yüksek olan meme kanseri hastaları için olağanüstü terapötik potansiyel sunan belirli bileşikler elde ettik. Son derece umut verici sonuçlar nedeniyle, seçilmiş birkaç bileşiğin daha ileri sentezleri şu anda laboratuvarlarımızda araştırılmaktadır.
  • Thumbnail Image
    Article
    Citation Count: 79
    Post-Synthetically Elaborated Bodipy-Based Porous Organic Polymers (pops) for the Photochemical Detoxification of a Sulfur Mustard Simulant
    (American Chemical Society, 2020) Çetin, M. Mustafa; Atılgan, Ahmet; Beldjoudi, Yassine; Liu, Jian; Stern, Charlotte L.; Çetin, Furkan M.; İslamoğlu, Timur; Farha, Omar K.; Deria, Pravas; Stoddart, Frasser J.; Hupp, Joseph T.
    Designing new materials for the effective detoxification of chemical warfare agents (CWAs) is of current interest given the recent use of CWAs. Although halogenated borondipyrromethene derivatives (4,4-difluoro-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene or BDP or BODIPY) at the 2 and 6 positions have been extensively explored as efficient photosensitizers for generating singlet oxygen (1 O2) in homogeneous media, their utilization in the design of porous organic polymers (POPs) has remained elusive due to the difficulty of controlling polymerization processes through cross-coupling synthesis pathways. Our approach to overcome these difficulties and prepare halogenated BODIPYbased porous organic polymers (X-BDP-POP where X = Br or I) represents an attractive alternative through post-synthesis modification (PSM) of the parent hydrogenated polymer. Upon synthesis of both the parent polymer, H-BDP-POP, and its post-synthetically modified derivatives, Br-BDP-POP and I-BDP-POP, the BET surface areas of all POPs have been measured and found to be 640, 430, and 400 m2 g-1, respectively. In addition, the insertion of heavy halogen atoms at the 2 and 6 positions of the BODIPY unit leads to the quenching of fluorescence (both polymer and solution-phase monomer forms) and the enhancement of phosphorescence (particularly for the iodo versions of the polymers and monomers), as a result of efficient intersystem crossing. The heterogeneous photocatalytic activities of both the parent POP and its derivatives for the detoxification of the sulfur mustard simulant, 2-chloroethyl ethyl sulfide (CEES), have been examined; the results show a significant enhancement in the generation of singlet oxygen (1 O2). Both the bromination and iodination of H-BDP-POP served to shorten by 5-fold of the time needed for the selective and catalytic photo-oxidation of CEES to 2-chloroethyl ethyl sulfoxide (CEESO).
  • Thumbnail Image
    Article
    Citation Count: 0
    Bir Dizi Prodigiosin ve 1,10-fenantrolin Türevlerinin Yeni Nesil Etkin Antikanser Tedavi Edici İlaçlar Ya Da Aktif Farmasötik Maddeler Olarak Tasarımı ve Yapısal İncelenmesi
    (2024) Çetin, M. Mustafa; Gül, Sümeyye Berfin
    Meme kanseri, beyin metastazı olasılığı en yüksek olan ikinci kanser türü olarak kabul edilmektedir. Bu yüzden meme kanseriyle ilgili araştırmaların çoğu beyin metastatik meme kanserinin mortalitesine yöneliktir. Ancak bu kanser türüne özgü etkili bir tedavi veya antikanser tedavi yöntemi mevcut değildir. Bu nedenle, meme kanseri ilerlemesinin modüle edilmesinde çok önemli rol oynayan HDAC ve mTOR enzimlerini inhibe edecek etkili ve yeni nesil antikanser terapötik ilaçların ve/veya aktif farmasötik maddelerin geliştirilmesi artan bir taleptir. Bu çalışmada, mTOR ve HDAC enzimlerine karşı oldukça güçlü antikanser terapötik ilaçlar ve/veya aktif farmasötik maddeler olarak bir dizi prodigiosin ve 1,10-fenantrolin türevinin yapı-aktivite ilişkisi ve in silico modellemesi incelenmiştir. Doğal ürün Ps ile karşılaştırıldığında, bu ligandlardan 20 tanesi, özellikle 2a, 6b, 13 ve 13a, HDAC1 ve/veya mTOR enzimlerine karşı –9.4 ile –7.1 kcal/mol arasında değişen çok umut verici bağlanma enerjileri ve 225 ile 569 nM arasında değişen inhibisyon sabitleri sergilemiştir. Özellikle 2a, 5, 6b, 7b ve 13 her iki enzime karşı iki taraflı etkinlik (dual action) göstermiştir. İn silico modelleme çalışmalarından elde edilen bulgular, MD simülasyonları ve Lipinski'nin beş kuralına göre ADMET çalışmasıyla da desteklenmiş olup, meme kanseri beyin metastazına sahip hastalar için olağanüstü bir terapötik potansiyel sağlamaktadır.
  • Thumbnail Image
    Book Part
    Citation Count: 0
    Urban-Architecture as a Battleground of Socio-Cultural Struggle
    (Brill, 2019) Çetin, M.
    Architecture is closely yet paradoxically connected to the two basic and complementary human instincts; to construct and to destruct, in other words to live and to die. Therefore, architecture and urbanism can be considered as the spatial dimensions of an ideological war of different interest groups in cities. Such a war mainly manifests itself as the polarisation between corporate sector and public sector, global and local, modern and traditional. Planning acts as a means of capitalist control over the urban (public) space under a macro-orthodoxy approach despite the public reaction via manipulation of public space through; microurbanism in urban-leftovers and queer-spaces, reclamation of landfills, and ephemeral architecture. A large body of community seem to resist through guerrilla war tactics of architecture against the comprehensive strategic war plans, technoscientific artillery, and devoted and well-trained troops of neo-liberal corporate bodies. Who will survive in such a relentless spatial war depends largely on the development of counter-strategies and accurate calculations based on game theory. The chapter will address the issue of reconstruction and resilience of cities with particular reference to the case of Istanbul, her transformation zones and conservation areas. Hence, the study will focus on urban paradigm shift and complexity of Istanbul as a multi-cultural, multi-layered metropolitan city in a post-modern era. The article intends to develop alternative strategies towards reshaping urban environment via architecture primarily by analysing the morphology of new urban spaces and emergent forms of life. Consequently, architecture of cities is argued as a para-military instrument for the tactical deployment of conflicting ideologies into an ongoing state of socio-cultural battle between opposing parties of the city. © Inter-Disciplinary Press 2016.