NMDA Tipi Glutamat Reseptörlerinin Çalışma Mekanizması ve Açık İyon Kanalı İnhibitörleri ile Etkileşimleri

dc.contributor.authorCarpenter, Tim
dc.contributor.authorGökhan, Şebnem Eşsiz
dc.date.accessioned2023-10-19T14:55:59Z
dc.date.available2023-10-19T14:55:59Z
dc.date.issued2018
dc.department-tempAdres Yazılmamış -- Kadir Has Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Biyoenformatik ve Genetik Bölümü, İstanbul, Türkiyeen_US
dc.description.abstractBu projenin amacı glutamat ve glisin nörotransmitterleri ile aktive olan tetramerik yapıdaki, ligant kapılı iyon kanalı ailesinin bir üyesi olan NMDA (N-metil-D-Aspartat) tipi glutamat reseptör iyon kanalının, iyon iletimine kapalı ve açık hallerinin hesaplamalı metotlar ile karakterize edilmesi üzerinedir. Projede bilgisayar bazlı sayısal metotlar kullanılarak reseptörde ligant bağlanması sonucu gerçeklesen lokal ve global hareketler hakkında bilgi elde edilmiştir. Projenin ilk basamağında NMDA reseptörünün yeni çözümlenmiş olan iki X- Ray yapısı baz alınıp, homoloji modellemesi yöntemi kullanılarak insan tipi NMDA modeli elde edilmiştir. Daha sonrasında proteinin dominant hareketlerini belirlemek icin normal mod analizini kullanılmıştır. Proteinler dinamik bir sistem olduğundan sayısal benzetim yöntemi olan moleküler dinamik metoduyla ligand-olmayan ve ligand-bağlı iki sistem simüle edilmiştir. 1300 nanosaniye koşturulan sistemlerde ligand bağlandığı bölgede kapanmaya sebep olurken, bu hareketin bağlayıcılar tarafından iyon kanalına iletildiği gözlemlenmiştir. Bu simülasyonların sonucunda gözlemlediğimiz bir diğer etki ise, ligant bağlandığı bölgeyi daha stabil hala getirerek reseptörün diğer bölgeleri ile etkileşimleri artırmaktadır.en_US
dc.identifier.citation0
dc.identifier.endpage39en_US
dc.identifier.scopusqualityN/A
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.trdizinid618469en_US]
dc.identifier.trdizinid618469en_US].
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/618469
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12469/4701
dc.identifier.wosqualityN/A
dc.language.isotren_US
dc.relation.publicationcategoryProjeen_US
dc.relation.tubitakinfo:eu-repo/grantAgreement/TÜBİTAK/KBAG/114Z867en_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectKimyaen_US
dc.subjectTıbbien_US
dc.subjectGenetik ve Kalıtımen_US
dc.subjectBiyokimya ve Moleküler Biyolojien_US
dc.titleNMDA Tipi Glutamat Reseptörlerinin Çalışma Mekanizması ve Açık İyon Kanalı İnhibitörleri ile Etkileşimlerien_US
dc.typeProjecten_US
dspace.entity.typeProject

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
4701.pdf
Size:
2.86 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Tam Metin / Full Text